前段时间，Boltz PBC 宣布完成 2800 万美元融资，不少媒体把焦点放在“AI 药物发现”“资本追捧”这些关键词上。但如果你真的关心 AI 在药物研发里到底有没有用，那更值得看的，其实是他们北京时间今天凌晨发布的一场 Boltz Lab 线上产品宣发。

昌平实验室陈明辰团队发布全球首个完全开源、端到端高亲和力蛋白-抗体设计模型PPIFlow：1.VHH单域抗体设计8靶7中；4个靶点达到single-digit nM，nM结合成功率33.8%；2.迷你蛋白7靶6个直接达到pM级；3.单轮实验仅测30个分子即可锁定pM-nM binder，无需后续亲和力成熟。目前，该模型已上线GitHub，面向全球免费开放，巢生为项目早期伙伴。

过去这段时间，AI 在生物医药领域几乎成了一种趋势正确。不谈 AI，好像就不算前沿；不加“AI 驱动”，项目就不够性感。但一个越来越难回避的问题是——AI 真的改变生物医药了吗？还是只是改变了 PPT？

来自华盛顿大学 David Baker 团队 2025 年发表在 bioRxiv 上的文献 《De novo Design of All-atom Biomolecular Interactions with RFdiffusion3》。该文献推出了全新的 RFdiffusion3 (RFD3) 框架，旨在解决蛋白质设计中难以精确处理与配体、核酸等非蛋白质组分全原子相互作用的难题。

瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）等机构团队在《Nature》发表题为“One-shot design of functional protein binders with BindCraft”的研究。团队开发的开源自动化工具BindCraft，依托AlphaFold2（AF2）网络反向传播机制，实现功能蛋白结合剂从头设计，实验成功率达10%-100% ，无需高通量筛选即可获得纳米摩尔级亲和力结合剂，为生物医学领域带来革命性突破。